El Decano de la Historia de Santa Rita de la Esquina
También se dedicó al periodismo, como Director propietario de "Adelante", "Temas" y "El Esquinense". Colaboró en "El Centinela del Litoral", "La Voz de Esquina" y los diarios capitalinos "época", "El Litoral" y el desaparecido Diario de Corrientes.
Muchos de sus trabajos, los editó él mismo como "Ediciones Temas. Esquina (Corrientes)" y fueron redactados con máquina de escribir, tirados a esténcil, impresos en una copiadora mimeógrafo Gestetner y anillados personalmente. Por ejemplo, "La Asamblea del Año XIII" (1963), "Apuntes de Geografía Electoral de Corrientes" (1963 y 1966), "Los Ejércitos Libertadores Correntinos" (1968), "Vocabulario Geográfico Correntino" (1969 y 1972), y los manuales, de Historia de Corrientes (1971) y de Geografía de Corrientes (1972). Los dos últimos fueron editados luego, lujosamente, en la década del 80 por Ediciones Cícero de Corrientes.
Participó y disertó en distintos congresos en Córdoba, Buenos Aires, Paraná, Corrientes y otros puntos del país. Miembro de distintas comisiones, resaltó su desempeño como asesor del Congreso Pedagógico Argentino por la provincia de Corrientes. Fue declarado "Hijo Dilecto de Esquina", distinción que le otorgó el Concejo Deliberante de la ciudad, por Resolución 077/94.
En la actualidad, su casa es visitada por muchos esquinenses como si se tratase de un museo. Miembro de la Junta de Historia de Corrientes primero, y de la Junta de Historia de la Provincia de Corrientes, luego. Uno de los asientos de la Junta lleva su nombre y lo ocupa otro esquinense, el actual presidente, Dardo Ramírez Braschi, quien se reconoce discípulo suyo y del cual se hace referencia más adelante.
También integró el Instituto Genealógico Correntino, la Sociedad Argentina de Historiadores y el Instituto Argentino de Ciencias Genealógicas. Con el tiempo, se constituyó en el decano de la historiografía de su localidad y la principal figura de referencia. Como sucede con prácticamente todos los historiadores vinculados esencialmente a una localidad, su indudable relieve, por circunstancias asociadas al invasivo proceso editorial porteño que ya hemos descrito, no ha trascendido de los límites del sudeste provincial, en los últimos decenios del siglo XX.
Como historiador editó varios libros. A su muerte, algunos quedan inéditos. El más trascendente de todos ellos es, a nuestro juicio, la "Historia de Santa Rita de la Esquina", que en 1988 le valió el Premio Pedro Ferré, instituido con motivo del IV Centenario de la Fundación de la Ciudad de Corrientes y editado por el Poder Ejecutivo provincial.
Sin embargo, a juicio de algunos historiadores locales, su aporte principal sería su "Vocabulario Geográfico Correntino".
Como docente, en ese mismo año 1988 publicó "Estudios Sociales de Corrientes", una síntesis para la enseñanza primaria de la historia, la geografía provinciales, y lo que hoy denominamos Formación Ética y Ciudadana, organizada como esquema de planeamiento anual, a través de diez unidades didácticas con punto de arranque en el ambiente geográfico, seguido de los primeros pobladores y de allí en más hasta rematar en la Guerra del Paraguay, luego lo atinente al gobierno provincial, los deberes y derechos de los habitantes de la provincia, el movimiento cooperativista y un agregado de raigambre patriótica y emocional referido a las Islas Malvinas.
La planificación de los "Estudios", se detalla hasta los comienzos del artiguismo en Corrientes, y el texto en sí, que tiene como remate previsto la Guerra del Paraguay. Las actividades y evaluaciones, se han aportado hasta el año 1853.
Consideramos que este folleto de Cafferata Soto es el primer intento con sustento docente de crear un texto para llevar la Historia y la Geografía de Corrientes a los establecimientos escolares, porque la exégesis de las publicaciones previas de Manuel Vicente Figuerero, Valerio Bonastre y Federico Palma, pese a la intención que expresan y haber sido editadas por el gobierno provincial con destino a los escolares, no aparecen aptas para ser empleadas directamente por los educandos, y además carecen, entre otras cuestiones, de actividades y criterios de evaluación.
Con respecto a sus trabajos más reconocidos, el "Vocabulario Geográfico Correntino" es una suerte de diccionario de topónimos que además de dar una referencia geográfica, explica el significado de los vocablos de origen guaraní. Y, en numerosas oportunidades, acompaña una referencia histórica de la cual explicita la fuente, que por lo común es un historiador o literato clásico correntino.
El aparato erudito incluye algunas notas al pie, colocadas informalmente, por ejemplo como "Información Complementaria", y una bibliografía compuesta principalmente de obras de Historia y Geografía de Corrientes, en los que predominan los autores correntinos considerados tradicionales.
Esta obra, a nuestro juicio deja pendiente un desafío para otros investigadores que quieran retomarla, para dotarla de una cartografía más detallada, mínimamente de nivel departamental, acorde a las posibilidades editoriales de hoy, que superan en mucho lo precario del pionero soporte editorial de Cafferata. Esta excelente fuente primaria, podría asimismo optimizarse a través de un mayor detalle del origen de los topónimos no guaraníes.
Finalmente, su "Historia de Santa Rita de la Esquina", recibió el Primer Premio de la "Comisión de Conmemoración de los 400 años de la Fundación de Corrientes", otorgado por un Jurado que integran tres miembros de la Academia Nacional de la Historia, los Doctores Ernesto Maeder y Miguel Ángel De Marco, y el Licenciado Armando Raúl Bazán. La envergadura y la trayectoria de los integrantes de ese Jurado, todas figuras vastamente reconocidas y de gran prestigio en el plexo historiográfico no ya provincial, sino nacional y aún internacional, dieron la medida del valor del trabajo de Cafferata Soto.
La obra en sí, consideramos que es trabajo histórico de formas convencionales, modélico a la hora de escribir una Historia local, que, con mucho de crónica y algunas interpretaciones personales, recorre todo el proceso histórico esquinense, tiene un apropiado aparato erudito, evidencia investigación en todos los archivos de la localidad, presenta una cartografía e imágenes apropiadas al propósito perseguido, transcribe documentos que son pertinentes, y aborda inclusive los temas institucionales que siempre debe esperarse ocupen un lugar preponderante en la Historia de una localidad de Corrientes: los procesos históricos parroquial, educativo, de las fuerzas del orden y de las diversas instituciones culturales y deportivas.
Tan pionera en lo histórico, la figura de Cafferata también lo fue a la hora de la polémica historiográfica planteada con otros investigadores en torno al momento fundacional esquinense, una situación que se ha venido dando a posteriori en gran número de localidades correntinas que ven envueltas en la penumbra los comienzos de su proceso histórico y buscan resolverlo, las más de las veces, persiguiendo la sanción de leyes que, si no hacen luz, al menos impongan orden en los debates y disputas que se suscitan.
En definitiva, nos arriesgamos a decir que Juan Daniel Cafferata Soto fue para los estudios históricos relacionados con Santa Rita de la Esquina, el Adelantado que tantos correntinos quisieran, en otro orden, hubiera dado la vida a sus localidades golpeando el rollo con su espada.